Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf18Q7TS55 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfsf18Q7TS55 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfsf18Q7TS55 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms