Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LnpkQ7TQ95 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LnpkQ7TQ95 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms