Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
1700010I14RikQ7TPG0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
1700010I14RikQ7TPG0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700010I14RikQ7TPG0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
1700010I14RikQ7TPG0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700010I14RikQ7TPG0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700010I14RikQ7TPG0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700010I14RikQ7TPG0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700010I14RikQ7TPG0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700010I14RikQ7TPG0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700010I14RikQ7TPG0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms