Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE6

Duxbl2, Double homeobox B-like, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Duxbl2Q7TNE6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Duxbl2Q7TNE6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Duxbl2Q7TNE6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Duxbl2Q7TNE6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms