Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkd1l2Q7TN88 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkd1l2Q7TN88 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkd1l2Q7TN88 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkd1l2Q7TN88 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd1l2Q7TN88 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms