Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmc8Q7TN58 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmc8Q7TN58 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmc8Q7TN58 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmc8Q7TN58 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms