Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snd1Q78PY7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snd1Q78PY7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snd1Q78PY7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snd1Q78PY7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms