Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed3Q78IS1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed3Q78IS1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmed3Q78IS1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms