Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd3eapQ76KJ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd3eapQ76KJ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd3eapQ76KJ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd3eapQ76KJ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms