Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYS1Q717R9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYS1Q717R9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYS1Q717R9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYS1Q717R9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYS1Q717R9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms