Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYDE1Q6ZW31 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYDE1Q6ZW31 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYDE1Q6ZW31 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYDE1Q6ZW31 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYDE1Q6ZW31 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms