Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RfflQ6ZQM0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RfflQ6ZQM0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RfflQ6ZQM0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RfflQ6ZQM0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RfflQ6ZQM0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RfflQ6ZQM0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms