Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smg5Q6ZPY2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg5Q6ZPY2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smg5Q6ZPY2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg5Q6ZPY2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg5Q6ZPY2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg5Q6ZPY2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg5Q6ZPY2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg5Q6ZPY2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smg5Q6ZPY2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms