Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFXL1Q6ZNB6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFXL1Q6ZNB6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFXL1Q6ZNB6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFXL1Q6ZNB6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFXL1Q6ZNB6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFXL1Q6ZNB6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFXL1Q6ZNB6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFXL1Q6ZNB6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFXL1Q6ZNB6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFXL1Q6ZNB6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFXL1Q6ZNB6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NFXL1Q6ZNB6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFXL1Q6ZNB6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NFXL1Q6ZNB6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NFXL1Q6ZNB6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NFXL1Q6ZNB6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFXL1Q6ZNB6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFXL1Q6ZNB6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NFXL1Q6ZNB6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFXL1Q6ZNB6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms