Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPNS3Q6ZMD2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPNS3Q6ZMD2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPNS3Q6ZMD2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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