Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FOXD4L3Q6VB84 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD4L3Q6VB84 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXD4L3Q6VB84 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXD4L3Q6VB84 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms