Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdk2Q6V4S5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdk2Q6V4S5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdk2Q6V4S5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdk2Q6V4S5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms