Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms