Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LRSAM1Q6UWE0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LRSAM1Q6UWE0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRSAM1Q6UWE0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRSAM1Q6UWE0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms