Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC171Q6TFL3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC171Q6TFL3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC171Q6TFL3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC171Q6TFL3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC171Q6TFL3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC171Q6TFL3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC171Q6TFL3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC171Q6TFL3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC171Q6TFL3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC171Q6TFL3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC171Q6TFL3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC171Q6TFL3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC171Q6TFL3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC171Q6TFL3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.3 ms