Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcaf3Q6QR59 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcaf3Q6QR59 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcaf3Q6QR59 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcaf3Q6QR59 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcaf3Q6QR59 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms