Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad54bQ6PFE3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad54bQ6PFE3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad54bQ6PFE3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad54bQ6PFE3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad54bQ6PFE3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad54bQ6PFE3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad54bQ6PFE3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad54bQ6PFE3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rad54bQ6PFE3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad54bQ6PFE3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad54bQ6PFE3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad54bQ6PFE3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad54bQ6PFE3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms