Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup98Q6PFD9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup98Q6PFD9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nup98Q6PFD9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup98Q6PFD9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nup98Q6PFD9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms