Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrm2bQ6PEE3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rrm2bQ6PEE3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrm2bQ6PEE3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrm2bQ6PEE3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms