Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RgmaQ6PCX7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RgmaQ6PCX7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RgmaQ6PCX7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RgmaQ6PCX7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RgmaQ6PCX7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RgmaQ6PCX7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RgmaQ6PCX7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RgmaQ6PCX7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RgmaQ6PCX7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RgmaQ6PCX7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RgmaQ6PCX7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RgmaQ6PCX7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RgmaQ6PCX7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms