Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bhlhb9Q6PB60 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhb9Q6PB60 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhb9Q6PB60 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.2 ms