Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo4Q6PAQ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo4Q6PAQ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo4Q6PAQ4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rexo4Q6PAQ4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rexo4Q6PAQ4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms