Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASC4Q6P4E1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASC4Q6P4E1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASC4Q6P4E1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASC4Q6P4E1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms