Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Podnl1Q6P3Y9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Podnl1Q6P3Y9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Podnl1Q6P3Y9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Podnl1Q6P3Y9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Podnl1Q6P3Y9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms