Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PrimpolQ6P1E7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PrimpolQ6P1E7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PrimpolQ6P1E7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PrimpolQ6P1E7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PrimpolQ6P1E7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PrimpolQ6P1E7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms