Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sec23ipQ6NZC7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sec23ipQ6NZC7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23ipQ6NZC7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sec23ipQ6NZC7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms