Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KANK3Q6NY19 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KANK3Q6NY19 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KANK3Q6NY19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KANK3Q6NY19 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms