Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Wdr44Q6NVE8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Wdr44Q6NVE8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Wdr44Q6NVE8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Wdr44Q6NVE8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Wdr44Q6NVE8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms