Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP4R4Q6NUP7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPP4R4Q6NUP7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP4R4Q6NUP7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP4R4Q6NUP7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms