Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
APOBEC3HQ6NTF7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
APOBEC3HQ6NTF7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
APOBEC3HQ6NTF7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
APOBEC3HQ6NTF7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
APOBEC3HQ6NTF7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
APOBEC3HQ6NTF7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
APOBEC3HQ6NTF7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
APOBEC3HQ6NTF7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
APOBEC3HQ6NTF7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
APOBEC3HQ6NTF7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms