Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN13Q6MZZ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN13Q6MZZ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN13Q6MZZ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN13Q6MZZ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms