Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDE12Q6L8Q7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE12Q6L8Q7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDE12Q6L8Q7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE12Q6L8Q7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE12Q6L8Q7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE12Q6L8Q7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE12Q6L8Q7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE12Q6L8Q7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE12Q6L8Q7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE12Q6L8Q7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE12Q6L8Q7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE12Q6L8Q7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE12Q6L8Q7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE12Q6L8Q7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE12Q6L8Q7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE12Q6L8Q7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE12Q6L8Q7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms