Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 35.45□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.582e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 31.4
NIPBLQ6KC79 LRP8-209ENST00000480045 3231 ntTSL 513.99□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 31.4
NIPBLQ6KC79 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 31.4
NIPBLQ6KC79 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 31.4
NIPBLQ6KC79 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 31.4
NIPBLQ6KC79 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 31.4
NIPBLQ6KC79 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.663e-6■■■■■ 31.4
NIPBLQ6KC79 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.74■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 31.2
NIPBLQ6KC79 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 31.2
NIPBLQ6KC79 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 31.2
NIPBLQ6KC79 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 31.2
NIPBLQ6KC79 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC9.46□□□□□ -0.91e-323■■■■■ 31
NIPBLQ6KC79 KPNA4-203ENST00000483437 510 ntTSL 53.28□□□□□ -1.881e-323■■■■■ 31
NIPBLQ6KC79 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 311.42□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 31
NIPBLQ6KC79 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 510.1□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 31
NIPBLQ6KC79 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.05□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 30.9
NIPBLQ6KC79 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 30.9
NIPBLQ6KC79 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.072e-7■■■■■ 30.9
NIPBLQ6KC79 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.142e-7■■■■■ 30.9
NIPBLQ6KC79 RPL23A-205ENST00000472628 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.954e-8■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ZC3H11A-206ENST00000453771 1892 ntTSL 58.37□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ZC3H11A-208ENST00000466470 944 ntTSL 28.09□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ZC3H11A-205ENST00000432282 682 ntTSL 58.09□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ZC3H11A-207ENST00000461980 822 ntTSL 27.46□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.832e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ZC3H11A-213ENST00000638800 7078 ntTSL 53.4□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.892e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.042e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 30.7
NIPBLQ6KC79 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.286e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC11.82□□□□□ -0.526e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.726e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.886e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.016e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 SCAF11-201ENST00000266589 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.51□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.066e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.126e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.156e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 NUDCD1-203ENST00000519607 2286 ntTSL 1 (best)7.79□□□□□ -1.166e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.186e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.266e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.274e-6■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.276e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.336e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.346e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.416e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.426e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.424e-6■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.476e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.516e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 SCAF4-204ENST00000467731 2976 ntTSL 1 (best)5.55□□□□□ -1.526e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.536e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.566e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.576e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.594e-6■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.596e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.596e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-211ENST00000464082 567 ntTSL 24.71□□□□□ -1.666e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 COPB1-204ENST00000526191 697 ntTSL 23.78□□□□□ -1.86e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)3.43□□□□□ -1.866e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 NUDCD1-204ENST00000521439 1172 ntTSL 1 (best)2.86□□□□□ -1.956e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.966e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.966e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.056e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.16e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.16e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.136e-8■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 TBCD-204ENST00000571316 1509 ntTSL 1 (best)13.44□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 TBCD-225ENST00000576996 827 ntTSL 513.18□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 TBCD-224ENST00000576760 1059 ntTSL 511.14□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 TBCD-214ENST00000574801 586 ntTSL 411.06□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 TBCD-206ENST00000571712 850 ntTSL 59.84□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 TBCD-211ENST00000572984 682 ntTSL 59.4□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 TBCD-219ENST00000576160 942 ntTSL 59.01□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 30.6
NIPBLQ6KC79 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 30.3
NIPBLQ6KC79 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.323e-6■■■■■ 30.3
NIPBLQ6KC79 WDR43-206ENST00000466067 628 ntTSL 25.63□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 30.2
NIPBLQ6KC79 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.992e-8■■■■■ 30.2
NIPBLQ6KC79 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 30.1
NIPBLQ6KC79 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.695e-11■■■■■ 29.7
NIPBLQ6KC79 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 29.1
NIPBLQ6KC79 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.533e-45■■■■■ 29.1
NIPBLQ6KC79 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.276e-10■■■■■ 29
NIPBLQ6KC79 RCC1L-204ENST00000616051 1610 ntTSL 222.34■■□□□ 1.176e-10■■■■■ 29
NIPBLQ6KC79 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.716e-10■■■■■ 29
NIPBLQ6KC79 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.566e-10■■■■■ 29
NIPBLQ6KC79 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.516e-10■■■■■ 29
NIPBLQ6KC79 ABHD17A-206ENST00000592757 740 ntTSL 318.23■□□□□ 0.516e-10■■■■■ 29
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 261.1 ms