Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg16l2Q6KAU8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg16l2Q6KAU8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg16l2Q6KAU8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg16l2Q6KAU8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg16l2Q6KAU8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms