Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ggnbp1Q6K1E7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms