Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CltbQ6IRU5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CltbQ6IRU5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CltbQ6IRU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms