Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ric1Q69ZJ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ric1Q69ZJ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ric1Q69ZJ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ric1Q69ZJ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ric1Q69ZJ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ric1Q69ZJ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ric1Q69ZJ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ric1Q69ZJ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms