Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Cdk13Q69ZA1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cdk13Q69ZA1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cdk13Q69ZA1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cdk13Q69ZA1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cdk13Q69ZA1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cdk13Q69ZA1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cdk13Q69ZA1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cdk13Q69ZA1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk13Q69ZA1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk13Q69ZA1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk13Q69ZA1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdk13Q69ZA1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cdk13Q69ZA1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdk13Q69ZA1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Cdk13Q69ZA1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cdk13Q69ZA1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cdk13Q69ZA1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms