Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CltcQ68FD5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CltcQ68FD5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CltcQ68FD5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CltcQ68FD5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CltcQ68FD5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CltcQ68FD5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CltcQ68FD5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CltcQ68FD5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CltcQ68FD5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CltcQ68FD5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CltcQ68FD5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CltcQ68FD5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CltcQ68FD5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CltcQ68FD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CltcQ68FD5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CltcQ68FD5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CltcQ68FD5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CltcQ68FD5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CltcQ68FD5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CltcQ68FD5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CltcQ68FD5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CltcQ68FD5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CltcQ68FD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CltcQ68FD5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CltcQ68FD5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CltcQ68FD5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms