Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATG9BQ674R7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATG9BQ674R7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG9BQ674R7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms