Protein–RNA interactions for Protein: Q659A1

ICE2, Little elongation complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE2Q659A1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ICE2Q659A1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ICE2Q659A1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ICE2Q659A1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ICE2Q659A1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ICE2Q659A1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ICE2Q659A1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ICE2Q659A1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ICE2Q659A1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ICE2Q659A1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ICE2Q659A1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ICE2Q659A1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ICE2Q659A1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ICE2Q659A1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ICE2Q659A1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ICE2Q659A1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms