Protein–RNA interactions for Protein: Q64345

Ifit3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3Q64345 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifit3Q64345 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifit3Q64345 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifit3Q64345 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifit3Q64345 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms