Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcg1Q64343 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Abcg1Q64343 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg1Q64343 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg1Q64343 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms