Protein–RNA interactions for Protein: Q64322

Npdc1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npdc1Q64322 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npdc1Q64322 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npdc1Q64322 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npdc1Q64322 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Npdc1Q64322 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms