Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf1Q64213 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf1Q64213 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf1Q64213 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms